Pomimo bogactwa faktów przytoczonych przez Comesa i zwolenników jego teorii kwasowości nie znalazła ona poparcia ze strony bardzo wielu badaczy. Występując przeciw teorii Comesa autorzy przytaczają następujące argumenty. Wszystkim wiadomo, że bardzo wiele roślin mających dość kwaśny sok, jak berberys, szczaw (do 1,1% kwasu szczawiowego), dzikie jabłka, szpinak i inne, podlega różnym chorobom infekcyjnym. Oprócz tego bardziej szczegółowe, bezpośrednie badania wykazały, że stopień odporności roślin nie zawsze idzie w parze z zawartością kwasów w soku komórkowym. I. Wawiłow badał odporność bardzo wielu botanicznych odmian owsa, pszenicy i różnych odmian róż w stosunku do różnych grzybów (Puccinia triticiana, P. graminis, Erysiphe graminis i innych). Doszedł on do wniosku, że zależność taką można zaobserwować tylko u niektórych roślin. Z drugiej strony, wszystkim znany jest rozwój rdzy, które w jednym stadium porażają zboża - rośliny o niewielkiej zawartości kwasów.

Wskaźniki odporności u roślin i nie tylko.